《苦海净土》三部曲 :
三部曲分别为《苦海净土：我们的水俣病》《神明的村庄》与《天之鱼》。《苦海净土：我们的水俣病》原名《海天之间》，1965年12月至1966年年末连载于杂志《熊本风土记》，1969年出版单行本。小说主要讲述了从公害责任认定到组建水俣病对策市民会议的经过，具体描述了发现水俣病的情形。《神明的村庄》1970年9月至1989年连载于季刊杂志《边境》，2004年出版石牟礼道子的作品全集时完稿，2006年出版单行本。小说讲述了1969年29个患者家庭从提起诉讼到第二年出席氮肥公司股东大会的过程，文中描写的“诉讼派”运动开始进入公众视野，受到社会广泛关注。《天之鱼》1972年连载于杂志《展望》，1974年由筑摩书店出版单行本。小说讲述了以水俣病患者川本辉夫为首的“自主交涉派”为向氮肥公司索赔而在其正门前举行静坐示威运动的经过，同时描写了水俣病患者的生活惨状。
《苦海净土》三部曲堪称日本生态文学的标志性作品，在日本公害文学中具有里程碑意义。石牟礼道子以半纪实的手法着力展现了患病村民们的惨状，揭露了资本家对自然的破坏和对民众的残害。同时，作者在书中强调罹患水俣病的不仅是这些村民，更是片面强调经济发展、盲目追求物质增长、忽视自然保护和生命尊严的整个时代。作者在批判的同时，还着力书写自然的美好，呼唤人类对自然的归属和依恋，强调重建人与自然的和谐共生。
三部曲中，《苦海净土：我们的水俣病》在1969年和1970年先后被授予熊日文学奖、第一届大宅壮一纪实文学奖，但均被作者婉拒。小说出版后，多次再版。